SciFinder Scholar 2007 - "Reaction Search"
SciFinder Scholar 2007 Reaction Search Application
CAS 데이터 베이스 중 Reaction 정보는 CAS REACT (세계 최대 Chemical Reaction DB)에서 manage되며, 매일 약 700~1300 건의 Reaction이 추가되고 있습니다.
Reaction Search는 거의 모든 검색 단계에서 다양한 목적(구조식/합성법 검색, Refine, Extend 등)으로 실행할 수 있습니다.
1. Explore Research Topic에서 정확한 이름으로 검색
2. Get Reactions /Get Related /Substance Search으로 검색 (반복 Refine, 검색 확장), Analyze/Refine 메뉴 아래 Reaction Search 및 Refine 가능.
3. 분자식으로 검색 (Molecular Formula)
4. Explore Reactions/Substances 메뉴 선택, Drawing Tool을 이용하여 직접 입력
SciFinder 2007에서는 검색 결과의 반응식, 각 Substance 마다 Link가 지원되기 때문에,
반응물, 시약(Reagent), 생성물, 촉매, 용매 중 역할을 지정하여 다른 반응식으로 쉽게 재구성할 수 있습니다. (Retrosynthetic patheway도 가능)
화학식을 직접 그리거나, 검색 결과에서 찾은 물질을 재구성하여 검색하는 등, SciFinder에서 사용되는 화학식 그리기 툴에서 활용할 수 있는 Tips 3종 Set !
1. Atom Mapping : Only to the same atom mapping (정확히 어디서 반응이 일어났는지 address)
[#M_예제 (Click)|Close|
_M#]2. Bond Marking : Lock & Specify where the reaction took place.
반응식에서 고정시키고자 하는 부분(Ring, s-bond, d-bonds)은 Locking(불변) 가능.
특정 결합에서 혹은 원소의 Exchange를 정확하게 짚어내고, 그 자리의 반응만을 찾고 싶은 경우.
3. Functional Groups : 일반적인 반응(eg. Aldehyde - Alcohol)을 검색 후 Refine, Filtering이 필요할 때.
일반적인 작용기는 그 구조를 일일이 그릴 필요 없이 Functional Group List에서 선택하여 클릭 !
General Search에 적합 (Not for precisely defined structure)
마지막으로 어제 소개해 드렸던 2007 버전의 새로운 기능, Combine Answer Set을 Reaction Search에 활용한 예제입니다. 위의 Bond Marking에서 사용했던 Reaction으로 해보죠 ^^
CAS REACT의 Get Reaction 검색 결과 총 285건, Answer Set을 Reaction1.sfr로 저장합니다.
검색 결과 중.. eg)
여기서 생성물의 Ester가 Substructure로 포함되지 않는 반응들만 찾아 보아요~
[#M_Answer 보기 (Click!)|Close| 검색 결과들의 Combine Feature를 이용하려면, 우선 제외할 Answer Set을 만든 후 저장된 식과 조합.
위와 같이 검색 Query 작성하여 Get Reaction 하면, 121건의 검색결과가 나옵니다. (벤젠 Lock)
Combine에서 Saved Answer Set (Reaction1.sfr) 불러오기.
4번째 Combine을 선택,
Current Set을 Saved Answer Set (Reaction1.sfr)에서 제외.
* Current Set : 121 건
Saved Set(Reaction1.sfr): 285 건
Alcohol, Ether, Carbonyl 등 포함된 것이 검색결과로 얻어집니다. 총 167 건
<Combine (조합)을 사용할 때, 유의할 사항>
반드시 같은 검색 결과끼리만 Combine 할 수 있음.
즉, Reference search set 끼리, Reaction search 끼리만 조합할 수 있습니다.
_M#]
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